發(fā)酵飼料中含有大量的有益微生物，例如乳酸菌、芽孢桿菌、酵母菌、擬桿菌和曲霉菌等。就目前而言，發(fā)酵飼料的常用菌種是乳酸菌、酵母菌和芽孢桿菌。這些微生物在動物體內(nèi)能夠通過自身及其代謝產(chǎn)物對致病菌產(chǎn)生非特異性的頡頏作用，能抑制或減少有害菌的生成，從而能調(diào)節(jié)畜禽腸道生態(tài)平衡。對于發(fā)酵飼料的優(yōu)缺點(diǎn)，一直眾說紛紜，但是主流還是非常認(rèn)可發(fā)酵飼料的。

發(fā)酵飼料的優(yōu)點(diǎn)：

1、可抑制飼料中有毒有害物質(zhì)，如豆粕中含有的大豆抗原蛋白、胰蛋白抑制因子、植物凝集素、脲酶等抗?fàn)I養(yǎng)因子，通過微生物發(fā)酵能改善其營養(yǎng)物質(zhì)的消化吸收，減少腹瀉的發(fā)生，提高動物健康。用枯草芽孢桿菌和米曲霉菌發(fā)酵后的豆粕，豆粕中大分子物質(zhì)從40%降低到2%和8%，胰蛋白酶抑制因子分別減少了96%和82%，僅用枯草芽孢桿菌發(fā)酵大豆粕，也得出了類似的結(jié)論，發(fā)酵豆粕中的胰蛋白酶抑制因子顯著下降，大豆的營養(yǎng)價(jià)值也有所提高。此外，通過微生物發(fā)酵后，能降低或是消除棉籽粕中含有的棉酚、環(huán)丙烯脂肪酸、植酸及植酸鹽、非淀粉多糖等抗?fàn)I養(yǎng)因子，增加采食量、維護(hù)動物健康、降低飼料中的有害物質(zhì)、提高動物機(jī)體免疫力。

2、發(fā)酵還可以利用一些雜糧、雜粕和農(nóng)副產(chǎn)品的下腳料等非常規(guī)飼料進(jìn)行發(fā)酵，這不僅能降低飼料的成本，還可以增加產(chǎn)品的收益。用酵母菌發(fā)酵的木薯片蛋白濃縮飼料代替豆粕，提高了瘤胃發(fā)酵效率、腸道微生物蛋白合成率和營養(yǎng)物質(zhì)消化率，并降低飼料成本。

3、厭氧發(fā)酵飼料，可以使飼料中的纖維物質(zhì)軟化，且芽孢桿菌、酵母菌等好氧微生物的存在為乳酸的厭氧發(fā)酵提供了良好的條件，使乳酸菌產(chǎn)生大量的乳酸，降低飼料的pH，使得發(fā)酵飼料產(chǎn)生特有的酸香味，改善適口性，提高動物采食量。利用乳酸菌對飼料進(jìn)行發(fā)酵時，在發(fā)酵期間可以產(chǎn)生酸性物質(zhì)可殺滅和抑制雜菌的生長，產(chǎn)生濃郁的酸香味，對于改善動物產(chǎn)品風(fēng)味和飼料的適口性具有良好的效果。

發(fā)酵飼料的缺點(diǎn)：

1、僅適合自配料客戶使用，若是直接飼喂全價(jià)顆粒料，沒辦法使用發(fā)酵飼料。

2、最好是現(xiàn)用現(xiàn)配，避免二次發(fā)酵引起全價(jià)料過酸。

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